Friedrich Franz Wilhelm Junghuhn était un botaniste, bryologue, ptéridologue et mycologue néerlandais (26 octobre 1809, Mansfeld – 24 avril 1864, Lembang).
Son père, Friedrich Junghuhn, était barbier et chirurgien ; sa mère, Christine Marie Schiele.
Il étudie à Halle et à Berlin de 1827 à 1831. Entre-temps, il publie en 1830 un article fondateur sur les champignons dans Limnaea. Ein Journal für Botanik.
En tant qu’étudiant, Junghuhn a connu des épisodes de dépression et des tentatives de suicide. Il est impliqué dans un « duel d’honneur », au cours duquel il est blessé, mais c’est son adversaire qui meurt de ses blessures. Il s’échappe et s’engage comme officier chirurgien dans l’armée prussienne, mais il est découvert et condamné à dix ans de prison. Il plaide l’aliénation mentale, ce qui lui permet de s’évader à l’automne 1833. Il s’engage ensuite comme médecin dans la Légion étrangère française (armée française) en Algérie. Mais il doit démissionner en raison de son mauvais état de santé. Il retourne à Paris, où il rencontre le célèbre botaniste néerlandais Christian Hendrik Persoon, qui lui recommande « de s’engager dans l’armée coloniale et de s’installer comme médecin dans les Indes néerlandaises ». Junghuhn accepte et quitte l’Europe par le port de Hellevoetsluis au début de l’été 1835, pour arriver à Djakarta le 13 octobre 1835.
Il s’installe sur l’île de Java et y reste jusqu’à la fin de sa vie, à l’exception d’un séjour en Hollande de 1849 à 1855 pour raison de santé, où il épouse Johanna Louisa Frederika Koch le 23 janvier 1850, avec qui il aura un fils.
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Il étudie la géologie, la géographie et la botanique de Java.