Le terme « coussins endocardiques » désigne un sous-ensemble de cellules du cœur en développement qui jouent un rôle essentiel dans la formation des septums cardiaques. Elles naissent des parois dorsale et ventrale du canal auriculo-ventriculaire et fusionnent pour le diviser en oreillettes et en ventricules. Ils participent à la septation du cœur et à la formation des valves auriculo-ventriculaires. Il s’agit de la partie située au milieu, entre les oreillettes et les ventricules. Le septum primum, membrane issue du toit de l’oreillette primitive, se développe vers les coussins endocardiques et forme avec eux une ouverture, l’ostium primum, jusqu’à la fusion complète et la formation du septum auriculo-ventriculaire primitif. Les coussins soutiennent le septum primum lorsqu’il devient la valve du foramen ovale, qui divise les oreillettes.
Les coussins forment également la partie membraneuse du septum interventriculaire.
L’absence de fusion des coussins avec le septum primum entraîne une anomalie grave dans laquelle l’ostium primum, qui devrait être complètement fermé, reste ouvert et permet au sang de passer entre les oreillettes, ce qui entraîne une baisse de la saturation artérielle en oxygène.