La saison 2006 de la Primera B, connue sous le nom de Premier Cup 2006 pour des raisons commerciales, était la dix-septième saison de la deuxième division du football professionnel colombien.
Système de tournoi
Les 18 équipes ont été réparties en deux régions nonagonales, dans lesquelles elles se sont affrontées lors d’un duel entre groupes dans les tournois Apertura et Finalización. Les deux premiers de chaque nonagonale se sont qualifiés pour le quadrangulaire final, d’où est sorti le vainqueur de chaque tournoi.
Le vainqueur du Tournoi d’ouverture affrontait le vainqueur du Tournoi de clôture pour désigner le champion de l’année et la promotion directe en Primera A pour la saison 2007, tandis que le second disputait la série de promotion avec l’avant-dernière équipe (17e) du tableau de relégation de la Primera División, un système mis en place à partir de cette saison.
Tournoi final
Définition de la deuxième place
La finale a été annulée après que La Equidad a remporté les deux tournois de l’année et a été promue directement en Primera A pour la saison 2007. Par conséquent, les deuxièmes de chaque tournoi ont disputé une série de matches aller-retour pour déterminer l’équipe qui participerait à la série de promotion. Au final, le Valledupar F. C. s’est qualifié pour la série de promotion avec un score cumulé de 3-2.
Série promotionnelle
Le Valledupar F. C. a affronté l’Atlético Huila, avant-dernier du classement de la Primera A. A l’issue de cette série, l’Atlético Huila est resté en Primera A pour la saison 2007 sur le score cumulé de 3-0.